Vattendjupet i Krossholmens hamn är vid normalvattenhöjd ca 2,3 meter på de flesta ställen. Vid in- eller utpasseringen vid D-bryggan finns emellertid en uppgrundning som ligger på ca 2,1 meters djup. Grundet ligger ca 6 meter rakt ut från den yttersta båten på D-bryggan. Djupgående båtar bör därför passera mellan aktern på yttersta båten vid D-bryggan och grundet 6 meter ut. Se kartan nedan.